Sistem DDV deluje tako, da vsak prodajalec v verigi od proizvajalca do končnega uporabnika obračuna davek na dodano vrednost in od njega odšteje DDV, ki ga je plačal sam pri nakupu blaga in storitev, potrebnih za to, da je naredil blago oz. storitev, ki ga je prodal.
Vsakdo zato v končni fazi načeloma plača le DDV, ki predstavlja razliko med davkom, ki ga je zaračunal svojemu neposrednemu kupcu (npr. končnemu potrošniku), ter davkom, ki je bil njemu zaračunan pri nakupu blaga in storitev v prejšnjih fazah.
DDV se pri nas praviloma obračunava in plačuje po splošni stopnji 22 % (velja enako za dobavo blaga in storitev). Po nižji stopnji 9,5 % se plačuje le za določene skupine dobave blaga in storitev, ki so naštete v Prilogi I Zakona o davku na dodano vrednost.